Płyty główne MSI są dostępne w wielu standardach - w najbardziej popularnym ATX, Extended ATX dla profesjonalnego zastosowania oraz w bardziej uniwersalnych rodzajach: Micro-ATX i Mini-ITX. Ta część jest jednym z najważniejszych elementów komputera, dlatego przy jej wyborze trzeba wziąć pod uwagę wyżej wymienione standardy. Rodzaj płyty głównej decyduje o wydajności, stabilności i niezawodnej pracy komputera. Części tego producenta znajdują zastosowanie przede wszystkim w świecie gamingu i e-Sportu. Wybór płyty głównej od MSI powinien opierać się na przeanalizowaniu gniazda procesora, chipsetu płyty, standardu pamięci czy oferowanych złącz. Takie parametry wpływają na kompatybilność i odpowiednią komunikację części, co przekłada się na właściwe działanie sprzętu komputerowego.